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Taq DNA連接酶

簡要描述:

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更新時間:2024-01-12

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Taq DNA連接酶

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規(guī)格

貨號

Taq DNA連接酶

1000U

A-PJ1091

Taq DNA連接酶

10KU

A-PJ1091

描述:Taq DNA 連接酶是一種熱穩(wěn)定性連接酶,能夠催化 磷酸二酯鍵的形成,使與同一互補靶 DNA 鏈雜交的兩條相 鄰寡核苷酸鏈的 5′-磷酸末端和 3′-羥基末端通過磷酸二酯 鍵相連。該連接反應只有當兩條寡核苷酸鏈與互補靶 DNA 配對,并且兩條寡核苷酸鏈之間沒有空隙的條件下才可 發(fā)生。因此,可以用它來檢測單堿基替換。在 45℃-65℃ 范 圍內,Taq DNA 連接酶均有活性。該酶在 1XHiFi Taq Ligase Buffer 中具有的保真性連接。

組分

QQ截圖20240110094643.jpg應用
雙鏈 DNA 切刻的修復
儲存:-20℃可保存半年,長期儲存請置于 -70℃。
活性定義:1 單位指 50μl 反應體系中,45℃ 條件下,15 分鐘內能使 50% 的 1μg 經 BstEII 消化的 λDNA 片段(12bp 粘性末端)發(fā)生連接所需要的酶量。該酶也可以使用 1×Taq DNA Ligase Buffer20 mM Tris-HCl(pH 7.6),25 mM KAc,10 mM Mg(Ac)2,10 mM DTT,1 mM NAD 和 0.1% Triton X-100,45℃ 溫育。 該酶需 NAD+ 作輔因子,在 10×Taq DNA 連接酶緩沖液中已添加 NAD+;為了延長 NAD+ 的半衰期,緩沖液應于 -70℃ 貯存。
使用方法
1、配制如下反應體系
DNA up to 1 µg
10×HiFi Taq Ligase Buffer 5 µl
Taq DNA Ligase 2 µl
滅菌水 up to 50 µl
2、45℃孵育 15min。



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PCR基本步驟及注意事項?

一、實驗原理

PCR是體外人工選擇性擴增DNA的一種方法,它類似于生物體內DNA的復制。在生物體內DNA復制需要模板、引物、DNA聚合酶、DNA解旋酶、 dNTPs;而體外PCR反應同樣需要類似的成分,有模板、引物、PCR Buffer、Taq酶、dNTPs。其中引物是人工設計的特定序列,實現對特定位置的擴增;PCR Buffer提供一個反應的緩沖環(huán)境;反應過程同生物體內一樣,DNA雙鏈打開,引物結合模板,延伸形成新鏈。而這些過程在生物體內靠DNA解旋酶解鏈,而在體外在通過控制反應溫度實現的。如常用94℃變性模板DNA打開雙鏈,在退火溫度處引物結合到模板上,最后在72℃完成延伸,并反復重復此過程即可實現對特定片段DNA的大量擴增。到第三循環(huán)開始才產生出和靶DNA區(qū)段相同的DNA分子,進一步循環(huán)地產生出靶DNA區(qū)段的指數加倍。

在擴增后期,由于產物積累,使原來呈指數擴增的反應變成平坦的曲線,產物不再隨循環(huán)數而明顯上升,這稱為平臺效應。平臺期(Plateau)會使原先由于錯配而產生的低濃度非特異性產物繼續(xù)大量擴增,達到較高水平。因此,應適當調節(jié)循環(huán)次數,在平臺期前結束反應, 減少非特異性產物。到達平臺期(Plateau)所需循環(huán)次數取決于樣品中模板的拷貝。

二、主要的成分

1.模板可以是多種形式,主要包括基因組DNA、質粒DNA、攜帶病毒的基因組DNA、PCR產物,cDNA等,但不能為RNA。對于不同類型的模板,其主要不同在于預變性的時間以及模板的量。一般對于大的基因組DNA預變性時間10min足夠,質粒DNA2min、攜帶病毒的基因組DNA預變性2min、PCR產物預變性2min即可。

注意cDNA為單鏈DNA,但仍可做PCR的模板,只不過在第一輪循環(huán)時只有一個引物結合,合成另一條鏈。從第二輪開始,兩個引物均與特異位點結合,從而實現了與常規(guī)PCR的接軌。而同作為單鏈的RNA卻不能進行PCR擴增,原因就在于實現PCR反應的是DNA聚合酶,只能特意識別DNA鏈。

2.對于模版的量來說,一般25ul體系DNA的質量為50—100ng。對于基因組DNA由于其結構比較復雜,提取的濃度也往往比較大,為防止?jié)舛冗^大對PCR造成影響,故需對提取的DNA進行梯度稀釋。否則濃度過高則可能會引起非特異性擴增。對于質粒及PCR產物由于其結構簡單,且提取濃度一般較低,則無需稀釋。

PCR實驗中應該注意的問題有哪些?

沒有ct值

檢測結果遇到沒有Ct值情況,排查是否有以下問題:

1、循環(huán)數不夠(一般不超過45循環(huán),不僅背景值提高,定量也不準);

2、PCR程序設置錯誤,檢測熒光信號的步驟有誤。一般SG法采用72℃延伸時采集,TaqMan法則一般在退火結束時或延伸時采集信號,另外熒光采集是否選中;

3、引物或探針降解。可通過PAGE電泳檢測引物和探針是否降解;

4、模板量可能降解或上樣量不足(不超過500ng,根據試劑盒說明書即可), 對未知濃度的樣本應從系列稀釋樣本的最高濃度做起;如果發(fā)生模板降解,應考慮樣本準備中雜質的引入及反復凍融的情況,建議將模板樣本小量分裝儲備,避免反復凍融;

5、引物探針是否合適(尤其是引物跨越內含子,以確保擴增基因組DNA;上下游引物Tm值超過4℃以上也會影響擴增)。

ct值過晚

在相對定量中, Ct值一般控制在15—25之間比較好,如果在絕對定量中, 對低拷貝數的樣品,Ct值會增大, 但是一般不宜超過40循環(huán), 否則定量不準確。

因此,判斷Ct值出現過晚是否屬于非正常情況, 需要根據具體實驗設計和目的進行。

1、擴增效率低。引物之間或者引物和探針的比例不合適, 需要進行優(yōu)化;引物或探針設計不合理, 需要重新設計;

2、PCR程序不合適, 改用三步法進行反應, 或者優(yōu)化退火/延伸溫度, 可以適當降低退火溫度; 退火/延伸時間短(可以在推薦的時間條件下延長10s);

3、MgCl2濃度不合適,增加鎂離子濃度等。PCR各種反應成分的降解或加樣量的不足;

4、PCR產物太長。PCR產物設計超過500bp;

5、模板中存在抑制物。用高純度模板進行PCR檢測或將模板進行稀釋。

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